More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 		 427 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  77.36 
 
 		 426 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  78.54 
 
 		 427 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  80 
 
 		 429 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  76.47 
 
 		 431 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  86.65 
 
 		 428 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  100 
 
 		 428 aa  863    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  80.14 
 
 		 429 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  78.69 
 
 		 428 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 		 427 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  80 
 
 		 429 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  79.91 
 
 		 429 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  80 
 
 		 429 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  79.91 
 
 		 429 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  76.83 
 
 		 427 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  76.42 
 
 		 427 aa  631  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  75.06 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  74.12 
 
 		 426 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  78.54 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  74.53 
 
 		 426 aa  624  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  74.12 
 
 		 426 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  76.6 
 
 		 431 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  72.71 
 
 		 427 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  77.3 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  73.82 
 
 		 426 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  77.05 
 
 		 430 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  72 
 
 		 426 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  73.41 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  75.76 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  74.82 
 
 		 425 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  74.76 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  72.88 
 
 		 427 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 		 425 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  69.93 
 
 		 430 aa  591  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  71.13 
 
 		 427 aa  587  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.88 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.27 
 
 		 426 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  60.48 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 428 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.32 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  64.3 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  58.7 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1687  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1705  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  61.59 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  61.96 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 425 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  65.55 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 425 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.48 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  60.96 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  64.27 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  59.91 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  59.91 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  65.55 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  60.24 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  65.07 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 429 aa  521  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  62.2 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  59.72 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  64.68 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  62.12 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 425 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  65.79 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  64.79 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  59.9 
 
 		 430 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>