More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3133 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 
428 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  74.08 
 
 
434 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  76.28 
 
 
428 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  80.97 
 
 
431 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  74.25 
 
 
429 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  74.08 
 
 
434 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  76.1 
 
 
429 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  81.44 
 
 
431 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  80.97 
 
 
431 aa  714    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  80.97 
 
 
431 aa  714    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  81.21 
 
 
431 aa  715    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  81.21 
 
 
431 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  77.91 
 
 
429 aa  691    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  81.44 
 
 
431 aa  702    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  73.02 
 
 
428 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 
429 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  80.97 
 
 
431 aa  714    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  80.97 
 
 
431 aa  714    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  74.42 
 
 
428 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  96.05 
 
 
430 aa  836    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  81.21 
 
 
431 aa  714    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  79.35 
 
 
431 aa  696    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 
433 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  74.25 
 
 
429 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  76.22 
 
 
427 aa  666    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  83.02 
 
 
430 aa  729    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
430 aa  865    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  76.64 
 
 
434 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  74.36 
 
 
429 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  75.17 
 
 
431 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  74.35 
 
 
425 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  74.08 
 
 
434 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  71.86 
 
 
432 aa  633  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  74.71 
 
 
426 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  72.83 
 
 
431 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  72.83 
 
 
431 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  71.53 
 
 
432 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  73.78 
 
 
429 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  70.82 
 
 
425 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  71.46 
 
 
431 aa  622  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  71.26 
 
 
435 aa  618  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 
433 aa  614  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  72.9 
 
 
428 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  71.2 
 
 
434 aa  617  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  72.03 
 
 
429 aa  612  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  71.1 
 
 
427 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  69.82 
 
 
435 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  70.86 
 
 
427 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 
427 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  73.18 
 
 
426 aa  608  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  69.93 
 
 
429 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  71.36 
 
 
431 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 
429 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  69.93 
 
 
427 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 
429 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
427 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 
427 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 
422 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 
429 aa  600  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  67.13 
 
 
431 aa  595  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  67.6 
 
 
427 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  67.59 
 
 
428 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  68.84 
 
 
428 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  68.84 
 
 
428 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 
428 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 
428 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 
427 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
427 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  69.27 
 
 
433 aa  589  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 
427 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  67.83 
 
 
427 aa  589  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 
427 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 
427 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  69.23 
 
 
426 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  70.88 
 
 
429 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  67.13 
 
 
427 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 
429 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
429 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
429 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 
430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  68.01 
 
 
430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  68.69 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>