More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2483 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  77.12 
 
 		 429 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 		 424 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  74.18 
 
 		 429 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  78.07 
 
 		 425 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 		 425 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  83.84 
 
 		 427 aa  730    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 		 424 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  74.18 
 
 		 429 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  81.88 
 
 		 426 aa  721    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  74.41 
 
 		 429 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 		 424 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  76.06 
 
 		 427 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  82.39 
 
 		 427 aa  732    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  85.71 
 
 		 427 aa  748    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  73.75 
 
 		 423 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 430 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  85.95 
 
 		 427 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  82.39 
 
 		 427 aa  728    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  77.41 
 
 		 425 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 		 424 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 424 aa  643    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  77 
 
 		 427 aa  663    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  79.38 
 
 		 427 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  78.12 
 
 		 425 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 		 425 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  75.29 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  74.76 
 
 		 426 aa  624  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  73.11 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  70.99 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  72.07 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  71.7 
 
 		 425 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  72.24 
 
 		 437 aa  614  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  71.7 
 
 		 425 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  70.75 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  70.05 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  70.21 
 
 		 426 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  70.75 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  71.87 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  71.97 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  70.75 
 
 		 424 aa  590  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 		 429 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  70.52 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.14 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  564  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.19 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.97 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.06 
 
 		 427 aa  564  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  65.83 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  65.89 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1176  enolase  64.92 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0192586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  64.67 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  68.02 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 		 431 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  66.67 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 422 aa  552  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.86 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>