More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05865 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 
431 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  100 
 
 
428 aa  881    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  83.92 
 
 
430 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 
430 aa  690    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  71.23 
 
 
427 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 
434 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 
434 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 
434 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 
435 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  65.5 
 
 
434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 
433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  66.12 
 
 
427 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  67.38 
 
 
423 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1824  phosphopyruvate hydratase  69.14 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  66.74 
 
 
435 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.81 
 
 
431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 
430 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 
430 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 
429 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
428 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  67.37 
 
 
426 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
425 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
427 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
428 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  66.27 
 
 
430 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
427 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 
428 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
427 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  64.65 
 
 
431 aa  548  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
426 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  61.36 
 
 
428 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
427 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 
424 aa  548  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
429 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 
428 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  60.42 
 
 
427 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
429 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  65.27 
 
 
427 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
425 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
427 aa  544  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
427 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
426 aa  543  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
429 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.96 
 
 
428 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
429 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.4 
 
 
429 aa  542  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
427 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
425 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  64.08 
 
 
432 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
424 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 
427 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.17 
 
 
430 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  61.96 
 
 
437 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
431 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
427 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 
427 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  61.36 
 
 
427 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 
426 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
424 aa  534  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
427 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
425 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  60.14 
 
 
433 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
424 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 
428 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 
431 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 
429 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
424 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 
425 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  62.83 
 
 
433 aa  531  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
431 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
431 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
433 aa  531  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.98 
 
 
425 aa  531  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 
424 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
431 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
425 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 
431 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
425 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  64.4 
 
 
428 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
430 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  62.06 
 
 
427 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>