More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2689 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 437 aa  891    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  88.79 
 
 		 437 aa  798    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 437 aa  817    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0309  phosphopyruvate hydratase  83.52 
 
 		 437 aa  739    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000038709  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  91.53 
 
 		 437 aa  829    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  89.24 
 
 		 437 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  87.41 
 
 		 437 aa  791    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.43 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  67.74 
 
 		 423 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  65.37 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.91 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.91 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.8 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  66.67 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  66.28 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.6 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.91 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  65.13 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.45 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  63.99 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  62.82 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.22 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 428 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.6 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.91 
 
 		 427 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  62.82 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.13 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.37 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.76 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.62 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  64.99 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.84 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.84 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.13 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.16 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  62.64 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  61.33 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  63.99 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  62.39 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.49 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.67 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.16 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>