More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0347 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 
437 aa  817    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  86.73 
 
 
437 aa  785    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
437 aa  890    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 
437 aa  818    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0309  phosphopyruvate hydratase  82.61 
 
 
437 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000038709  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  86.73 
 
 
437 aa  786    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  86.5 
 
 
437 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.06 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  66.9 
 
 
423 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.88 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  66.28 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  63.28 
 
 
433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  65.82 
 
 
426 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 
433 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.06 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.45 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.22 
 
 
427 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  64.52 
 
 
430 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  62.96 
 
 
427 aa  557  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 
430 aa  555  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.37 
 
 
428 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 
429 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
427 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.07 
 
 
429 aa  551  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
427 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 
428 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 
431 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 
431 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 
429 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.14 
 
 
428 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.16 
 
 
424 aa  547  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.16 
 
 
427 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  63.13 
 
 
431 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
429 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 
430 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 
429 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 
427 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.39 
 
 
429 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.61 
 
 
427 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.16 
 
 
430 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  63.3 
 
 
429 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.67 
 
 
433 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  63.78 
 
 
430 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
427 aa  544  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  62.93 
 
 
429 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
428 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  64.43 
 
 
434 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.9 
 
 
426 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
428 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.75 
 
 
422 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  61.43 
 
 
432 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  60.82 
 
 
435 aa  536  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
427 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  62.7 
 
 
426 aa  537  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
427 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  62.16 
 
 
427 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  61.1 
 
 
425 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  61.28 
 
 
434 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  61.28 
 
 
434 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  62.84 
 
 
427 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
427 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  62.39 
 
 
429 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  62.56 
 
 
430 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
429 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 
427 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  61.78 
 
 
425 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
427 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  61.87 
 
 
424 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
428 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  62.47 
 
 
431 aa  528  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  62.33 
 
 
430 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
429 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  61.01 
 
 
432 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  60.59 
 
 
434 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
427 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  61.05 
 
 
433 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  61.87 
 
 
429 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  62.79 
 
 
430 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  63.07 
 
 
429 aa  525  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
425 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  61.52 
 
 
431 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  61.78 
 
 
425 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  60.59 
 
 
434 aa  527  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>