More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3012 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 		 426 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  99.77 
 
 		 429 aa  866    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  76.65 
 
 		 424 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  98.14 
 
 		 429 aa  853    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  76.76 
 
 		 425 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  87.74 
 
 		 425 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  88.58 
 
 		 429 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  77.59 
 
 		 426 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  76.53 
 
 		 425 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  87.03 
 
 		 425 aa  741    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  76.76 
 
 		 425 aa  653    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 		 424 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 		 424 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 427 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  74.53 
 
 		 430 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  76.89 
 
 		 427 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  77.05 
 
 		 427 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  74.53 
 
 		 424 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 425 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  77.93 
 
 		 427 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 		 424 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  77.59 
 
 		 424 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  76.58 
 
 		 427 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  79.86 
 
 		 427 aa  689    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  78.42 
 
 		 427 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  76.53 
 
 		 427 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 429 aa  867    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  80.33 
 
 		 427 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  72.17 
 
 		 425 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  71.46 
 
 		 425 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  71.46 
 
 		 425 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  75.82 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 425 aa  627  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 		 426 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  70.88 
 
 		 423 aa  626  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  74.23 
 
 		 437 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  71.46 
 
 		 425 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 424 aa  616  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  75.18 
 
 		 424 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 425 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  68.94 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  68.94 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.89 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.96 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 		 430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 429 aa  571  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  65.9 
 
 		 437 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 428 aa  564  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 		 434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  64.53 
 
 		 437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 		 428 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  64.79 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>