More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0277 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  74.11 
 
 		 431 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  79.77 
 
 		 430 aa  696    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 430 aa  876    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  78.04 
 
 		 428 aa  690    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  70.85 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  70.14 
 
 		 423 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 435 aa  584  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  68.29 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.21 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 		 430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 434 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  67.6 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 		 430 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1824  phosphopyruvate hydratase  68.96 
 
 		 425 aa  574  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  68.88 
 
 		 425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  67.45 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.97 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  66.97 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 427 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  68.24 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.73 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 433 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.5 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  67.68 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  66.28 
 
 		 431 aa  561  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  554  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 		 428 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.27 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  66.04 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  67.3 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  66.97 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  67.62 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  65.03 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  64.1 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.49 
 
 		 426 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>