More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0167 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  77.59 
 
 		 426 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 425 aa  851    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  72.94 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  70.59 
 
 		 424 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  70.05 
 
 		 430 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  72.17 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 		 425 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 		 424 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  70.35 
 
 		 426 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  70.82 
 
 		 424 aa  594  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  70.59 
 
 		 424 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  69.65 
 
 		 425 aa  597  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  70.28 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  68.87 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  70.05 
 
 		 425 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  70.28 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  70.28 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  69.18 
 
 		 424 aa  584  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  68.82 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  68.87 
 
 		 427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  68.24 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  69.81 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  69.81 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 		 425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  68.88 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 423 aa  569  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  68.97 
 
 		 437 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  68.32 
 
 		 424 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  66.51 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.71 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.93 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.44 
 
 		 424 aa  541  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 428 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  62.32 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  65 
 
 		 426 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.38 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.73 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  63.33 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  63.38 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>