More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0928 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  79.25 
 
 
428 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  73.65 
 
 
429 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  76.29 
 
 
426 aa  638    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  77.49 
 
 
427 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  77.36 
 
 
427 aa  658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  78.44 
 
 
429 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  77.59 
 
 
426 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  76.42 
 
 
427 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 
427 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  77.59 
 
 
427 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 
425 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  73.65 
 
 
429 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  79.39 
 
 
430 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  77.36 
 
 
427 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  75.82 
 
 
426 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
425 aa  856    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  73.65 
 
 
429 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  76.24 
 
 
429 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  75.24 
 
 
429 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  75.47 
 
 
426 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  76.3 
 
 
427 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  70.52 
 
 
427 aa  621  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  73.71 
 
 
425 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  74.29 
 
 
426 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  75.59 
 
 
428 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  72.88 
 
 
428 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  74.41 
 
 
426 aa  618  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  72.17 
 
 
426 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  74.12 
 
 
431 aa  614  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  72.54 
 
 
431 aa  614  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  73.49 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  74.24 
 
 
427 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  72.88 
 
 
428 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  73.88 
 
 
429 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  72.64 
 
 
428 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  74.35 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 
425 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
429 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
430 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
428 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
430 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
425 aa  558  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  67.53 
 
 
429 aa  551  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 
429 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.11 
 
 
426 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
425 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  66.91 
 
 
427 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.95 
 
 
428 aa  548  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
427 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
429 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
425 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
425 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
432 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
429 aa  544  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.51 
 
 
431 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.51 
 
 
431 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
429 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
429 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
429 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
433 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  65.79 
 
 
424 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
429 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
430 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
427 aa  541  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
429 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
425 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.85 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
428 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  61.39 
 
 
429 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.15 
 
 
431 aa  534  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.01 
 
 
428 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  65.17 
 
 
437 aa  537  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  63.2 
 
 
433 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  63.86 
 
 
431 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
425 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  62.71 
 
 
433 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 
430 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  63.04 
 
 
430 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  60.77 
 
 
430 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  61.5 
 
 
430 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  63.33 
 
 
423 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
427 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
428 aa  531  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  64.54 
 
 
432 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
424 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.18 
 
 
425 aa  531  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
425 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  61.88 
 
 
429 aa  534  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.59 
 
 
427 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
431 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>