More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0306 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
427 aa  857    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  71.43 
 
 
425 aa  621  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  68.24 
 
 
428 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  69.63 
 
 
429 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 
425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
430 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  68.85 
 
 
426 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
430 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
429 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
430 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  65.89 
 
 
431 aa  584  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
431 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
431 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  67.76 
 
 
428 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  66.98 
 
 
428 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 
429 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
429 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  70.52 
 
 
426 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.47 
 
 
429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  62.7 
 
 
431 aa  558  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  66.98 
 
 
427 aa  558  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 
433 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
431 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 
424 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
431 aa  551  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 
425 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
426 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
434 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
426 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
425 aa  552  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 
429 aa  548  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 
429 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 
431 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 
428 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 
425 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  64.71 
 
 
429 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  62.59 
 
 
427 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
427 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 
429 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
428 aa  546  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.12 
 
 
427 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_533  enolase  62.53 
 
 
428 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  66.19 
 
 
426 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 
422 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  69.29 
 
 
429 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
425 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 
428 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
428 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.13 
 
 
428 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
425 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  60.94 
 
 
426 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  541  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  63.07 
 
 
426 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 
428 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
427 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 
425 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
425 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
427 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
428 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  66.43 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.38 
 
 
425 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  62.47 
 
 
432 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 
429 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 
426 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  61.54 
 
 
434 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
424 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  63.92 
 
 
427 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  61.31 
 
 
434 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  64.27 
 
 
426 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  61.31 
 
 
434 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>