More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0662 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0775  phosphopyruvate hydratase  92.09 
 
 		 432 aa  809    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0662  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 431 aa  877    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  64.07 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  62.79 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  63.36 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  63.55 
 
 		 426 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  63.36 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  63.27 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 		 430 aa  534  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  61.12 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  60.7 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  59.29 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  59.53 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 		 430 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  62.59 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1722  phosphopyruvate hydratase  61.65 
 
 		 432 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  59.53 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  61.07 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  59.4 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  59.4 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  59.86 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  60.61 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  61.65 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  61.23 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  60.52 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  59.29 
 
 		 428 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  60.37 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  60.37 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  60.19 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  59.76 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  58.59 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  60.05 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  59.77 
 
 		 428 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  59.07 
 
 		 428 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 431 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  57.75 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  62.29 
 
 		 428 aa  510  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  58.12 
 
 		 429 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  59.15 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  58.7 
 
 		 431 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  61.45 
 
 		 427 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  57.21 
 
 		 432 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  60.52 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 429 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  61.31 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  61.93 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  61.23 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  60.76 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  60.47 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2794  enolase  62.82 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  61.23 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  57.31 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  58.33 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  58.03 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  58 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  59.81 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  58.03 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  58 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  57.98 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 		 431 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  58.63 
 
 		 426 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  59.86 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  57.93 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  58.53 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  58.73 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  60.05 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  58.77 
 
 		 431 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  58.77 
 
 		 431 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  57.85 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  58.39 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1631  enolase  58.99 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  57.51 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  58.49 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  57.44 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  58.31 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  59.62 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  59.81 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  58.31 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>