More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0849 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 426 aa  865    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 426 aa  865    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 427 aa  601  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  67.84 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  68.56 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 		 427 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.49 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  67.54 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  68.31 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 431 aa  564  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.89 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  63.85 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  63.15 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1839  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0962098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  62.85 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.72 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 431 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  65.3 
 
 		 422 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.02 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.38 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  62.8 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 		 430 aa  541  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  61.2 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  61.66 
 
 		 434 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  61.2 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  62.24 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>