More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0852 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
426 aa  857    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  72.34 
 
 
426 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  69.18 
 
 
427 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  69.98 
 
 
427 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 
428 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
427 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 
428 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  67.84 
 
 
428 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  66.82 
 
 
426 aa  588  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  70.28 
 
 
425 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 
427 aa  588  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
427 aa  586  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  69.03 
 
 
427 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 
428 aa  584  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  69.41 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 
428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  66.2 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
428 aa  568  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
427 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
430 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
427 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
427 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 
429 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 
429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
426 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
429 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
428 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.78 
 
 
424 aa  558  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
429 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3110  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151465  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3085  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000118024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
428 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
426 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3168  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00128116  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
433 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
429 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3149  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00318163  normal  0.304263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 
429 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3350  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
431 aa  554  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000582829  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
428 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
431 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3266  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
432 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  0.113056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3233  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
431 aa  554  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0388546  normal  0.0683128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
432 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1115  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
431 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00458035  normal  0.795235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1186  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
431 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0854743  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1185  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
431 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1116  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
431 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 
429 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
428 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 
429 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
427 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
431 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1205  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
431 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000056862  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1237  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
431 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00127737  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3136  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
431 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00228262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
425 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 
429 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.7 
 
 
429 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
431 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
428 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  64.4 
 
 
428 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
429 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
427 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1196  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.061056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
427 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
429 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 
431 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 
431 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
428 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
431 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>