More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4532 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 429 aa  873    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  95.34 
 
 		 429 aa  815    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  74.82 
 
 		 428 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  81.52 
 
 		 431 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  72.49 
 
 		 429 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  70.88 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  70.17 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.59 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  68.01 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  69.41 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  68 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  67.77 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_533  enolase  65.56 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  65.35 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  67.87 
 
 		 426 aa  571  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  65.35 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 433 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.53 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  67.06 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.23 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  65.79 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  63.98 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  64.47 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  66.43 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.29 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.92 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.31 
 
 		 427 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  62.32 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  63.27 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.83 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  63.57 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  64.37 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 427 aa  544  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  63.97 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 429 aa  544  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.37 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  64.18 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  63.31 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  64.37 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  65.55 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  63.31 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>