More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_533 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  98.13 
 
 		 428 aa  867    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  94.63 
 
 		 428 aa  823    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_533  enolase  100 
 
 		 428 aa  885    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  64.79 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  65.4 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.8 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  66.27 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  63.74 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  64.65 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  63.23 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  63.49 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  62.18 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  62.09 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.19 
 
 		 422 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  61.56 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  62.15 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  60.7 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  63.57 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  63.77 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  64.27 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 		 427 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  61.21 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 430 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  61.56 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.07 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  60.28 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00171  phosphopyruvate hydratase  62.33 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  60.89 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  61.77 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  62.59 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  60.51 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  61.65 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  60.52 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  61.18 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  60.19 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  60.33 
 
 		 425 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  61.63 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  60.14 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  59.06 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  61.21 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  60.37 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  60.14 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  60.33 
 
 		 425 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  60.99 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  60.84 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  60.28 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>