86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3143 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  100 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  80.9 
 
 		 181 aa  296  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  68.18 
 
 		 189 aa  250  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  70.93 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  68.18 
 
 		 189 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  69.36 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  67.63 
 
 		 189 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  68.6 
 
 		 183 aa  237  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  67.44 
 
 		 183 aa  237  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  65.7 
 
 		 174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  35.47 
 
 		 171 aa  94.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  31.95 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  34.81 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  32 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  35.5 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.06 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  28.32 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  29.94 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  25.58 
 
 		 704 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  29.52 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  23.56 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  22.6 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  29.84 
 
 		 369 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.18 
 
 		 419 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  28.57 
 
 		 341 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.73 
 
 		 418 aa  51.2  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 		 346 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.31 
 
 		 419 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  28.57 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.18 
 
 		 423 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.18 
 
 		 423 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.18 
 
 		 423 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  27.93 
 
 		 350 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  29.44 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.06 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  30.82 
 
 		 395 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.16 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  37.19 
 
 		 1949 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  37.19 
 
 		 1949 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  22.1 
 
 		 336 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.24 
 
 		 410 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.24 
 
 		 410 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.24 
 
 		 410 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.24 
 
 		 410 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.16 
 
 		 417 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.46 
 
 		 410 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  31.01 
 
 		 942 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4118  excinuclease ABC, A subunit  32.56 
 
 		 952 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1974 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.16 
 
 		 410 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  36.13 
 
 		 1945 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  36.97 
 
 		 1957 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  26.7 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  36.13 
 
 		 1971 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  28.89 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1983 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.36 
 
 		 2021 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1964 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  34.43 
 
 		 1959 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1964 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1964 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2183  excinuclease ABC, A subunit  30.47 
 
 		 945 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.666287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  35.29 
 
 		 2098 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0488  excinuclease ABC, A subunit  34.45 
 
 		 1965 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3449  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  28.74 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1996 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  36.13 
 
 		 1967 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1996 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.13 
 
 		 1970 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.13 
 
 		 1970 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1997 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 		 1970 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.38 
 
 		 410 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.13 
 
 		 1971 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.13 
 
 		 1970 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  35.29 
 
 		 1997 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  37.36 
 
 		 1935 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>