71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1586 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  100 
 
 
704 aa  1440    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01535  hypothetical protein  47.28 
 
 
528 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1049  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  48.1 
 
 
515 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5436  putative cytoplasmic protein  41.44 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0569  hypothetical protein  40.95 
 
 
525 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00952601  normal  0.303027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3787  hypothetical protein  42.91 
 
 
498 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32211  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1209  hypothetical protein  40.15 
 
 
516 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.609873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2524  hypothetical protein  38.83 
 
 
532 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  46.7 
 
 
182 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  45.36 
 
 
194 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  49.46 
 
 
184 aa  182  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  45.16 
 
 
202 aa  180  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  40.8 
 
 
171 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  39.89 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 
323 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  38.01 
 
 
334 aa  98.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  35.26 
 
 
344 aa  97.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  33.33 
 
 
359 aa  95.5  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  31.55 
 
 
187 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  33.33 
 
 
187 aa  92  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  32.12 
 
 
194 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  31.84 
 
 
395 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  32.32 
 
 
346 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  29.44 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  31.18 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.74 
 
 
418 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.33 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  28.49 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.74 
 
 
417 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.74 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  28.49 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  30.73 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.36 
 
 
183 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  28.85 
 
 
368 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  29.07 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.7 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.7 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  26.16 
 
 
181 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.65 
 
 
348 aa  66.6  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.45 
 
 
425 aa  66.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  25.58 
 
 
178 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  29.78 
 
 
336 aa  64.7  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  27.59 
 
 
174 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  29.79 
 
 
340 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  29.03 
 
 
369 aa  62  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28 
 
 
346 aa  61.6  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3449  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.33 
 
 
233 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  24.87 
 
 
341 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  26.71 
 
 
172 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  28.57 
 
 
380 aa  51.2  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  26.88 
 
 
350 aa  46.2  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>