61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4491 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  47.35 
 
 
350 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  46.49 
 
 
395 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  42.46 
 
 
368 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  41.5 
 
 
369 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  44.77 
 
 
337 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
323 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  24.93 
 
 
344 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  29.5 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  33.98 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  28.98 
 
 
341 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27 
 
 
419 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.93 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.93 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.93 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  23.97 
 
 
336 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.63 
 
 
417 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.81 
 
 
418 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.52 
 
 
419 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.35 
 
 
417 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.35 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  25.35 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.35 
 
 
410 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  25.07 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.07 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  33.33 
 
 
704 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.16 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.51 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.73 
 
 
171 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  24.91 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  32.64 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  32.32 
 
 
194 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  23.39 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  32.47 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  30.5 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  22.95 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  26.39 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  29.17 
 
 
184 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  24.76 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  32.14 
 
 
187 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.27 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.6 
 
 
176 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  27.13 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  26.2 
 
 
182 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  29.59 
 
 
175 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  29.02 
 
 
175 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  30.05 
 
 
189 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  27.8 
 
 
189 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3449  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  29.79 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  28.43 
 
 
183 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  28.29 
 
 
189 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  26.53 
 
 
174 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>