46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3449 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3449  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  39.77 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  38.73 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  31.93 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  34.81 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1181  hypothetical protein  39.77 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.371783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0910  hypothetical protein  38.32 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.754365  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.95 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.82 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3186  hypothetical protein  36.46 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  29.71 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  35.71 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.91 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  34.32 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0995  hypothetical protein  37.38 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  33.52 
 
 		 350 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  28 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1320  hypothetical protein  37.14 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  32.5 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  29.33 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  31.38 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  28.57 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  29.89 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  26.9 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  29.31 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  31.5 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  26.78 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  27.86 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.58 
 
 		 417 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.58 
 
 		 417 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  33.07 
 
 		 183 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.67 
 
 		 419 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.58 
 
 		 423 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.58 
 
 		 423 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.58 
 
 		 423 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  25.27 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  33.54 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  32.28 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.91 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.41 
 
 		 425 aa  43.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  29.14 
 
 		 174 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.91 
 
 		 419 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1168  hypothetical protein  35.06 
 
 		 153 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  23.12 
 
 		 336 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.91 
 
 		 410 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>