62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0121 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  100 
 
 
176 aa  369  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  41.76 
 
 
171 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  39.89 
 
 
704 aa  128  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  34.64 
 
 
202 aa  114  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  37.21 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  37.97 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  36.21 
 
 
182 aa  105  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  34.43 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
323 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  33.91 
 
 
173 aa  84  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  32.4 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  32.37 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  30.06 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  31.07 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  30.06 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  31.03 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  28.49 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  27.6 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  31.03 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  26.29 
 
 
344 aa  64.7  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  25.99 
 
 
395 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.6 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  26.4 
 
 
350 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  32.52 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  28.85 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.39 
 
 
419 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3449  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.82 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.1 
 
 
423 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.1 
 
 
423 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.61 
 
 
346 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.1 
 
 
423 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  29.48 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  28.04 
 
 
368 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.06 
 
 
348 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.99 
 
 
417 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.99 
 
 
417 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  31.79 
 
 
334 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.27 
 
 
346 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.1 
 
 
418 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  26.67 
 
 
369 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  28.74 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.45 
 
 
410 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.45 
 
 
410 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.45 
 
 
410 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.45 
 
 
410 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.45 
 
 
410 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.29 
 
 
410 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  27.81 
 
 
340 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.34 
 
 
419 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.28 
 
 
425 aa  48.5  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  26.8 
 
 
380 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  25.41 
 
 
336 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>