63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2174 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  100 
 
 		 337 aa  694    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  46.77 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  44.48 
 
 		 359 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  44.77 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  40.41 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  36.76 
 
 		 369 aa  178  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  34.23 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  31.29 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  31.18 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  33.54 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.67 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.72 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.61 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.61 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.24 
 
 		 418 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 410 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  28.79 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.79 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.27 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.35 
 
 		 419 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.24 
 
 		 417 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.66 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  25.07 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.95 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.95 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.95 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.95 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.95 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  28.96 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  38.18 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  33.33 
 
 		 171 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.18 
 
 		 704 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  27.67 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  32.52 
 
 		 182 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3449  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  38.73 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  34.91 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.89 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  32.56 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  23.02 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  38.01 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  31.79 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.06 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  30.67 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.33 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  33.75 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  30.43 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  28.09 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  28.89 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  26.97 
 
 		 181 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  28.98 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.75 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  30.47 
 
 		 189 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>