58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0694 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  100 
 
 		 369 aa  764    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  75.2 
 
 		 368 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  41.5 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  37.43 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  35.38 
 
 		 350 aa  193  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  36.76 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  26.24 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  25.54 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.63 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.14 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.11 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  25.07 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.9 
 
 		 418 aa  92.8  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.97 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.75 
 
 		 419 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.86 
 
 		 423 aa  89.4  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.86 
 
 		 423 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.86 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.4 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  26.55 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.17 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.17 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.55 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.17 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.17 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.17 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.55 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.18 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.18 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.18 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.18 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  26.18 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.18 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  25.27 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  25.54 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  29.57 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  31.41 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  29.03 
 
 		 704 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  28.42 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.86 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  32.65 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  27.45 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.03 
 
 		 194 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  24.92 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  26.67 
 
 		 176 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  29.84 
 
 		 178 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  23.05 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  27.32 
 
 		 187 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  22.02 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  25 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  28.21 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  28.17 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  28.17 
 
 		 189 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  28.12 
 
 		 181 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>