67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5904 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  94.87 
 
 
410 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.54 
 
 
423 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.27 
 
 
410 aa  854    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.27 
 
 
410 aa  854    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  81.82 
 
 
419 aa  720    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 
423 aa  729    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 
423 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.27 
 
 
410 aa  854    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.51 
 
 
410 aa  853    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.27 
 
 
410 aa  854    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  94.87 
 
 
410 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  99.76 
 
 
410 aa  857    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  94.87 
 
 
410 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  94.87 
 
 
410 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  94.62 
 
 
410 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  100 
 
 
410 aa  858    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.05 
 
 
419 aa  754    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  99.27 
 
 
410 aa  854    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86 
 
 
418 aa  757    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 
417 aa  749    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.9 
 
 
417 aa  743    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.27 
 
 
410 aa  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  91.2 
 
 
410 aa  798    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  51.46 
 
 
425 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  40.12 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.31 
 
 
348 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
346 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  31.25 
 
 
340 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  29.18 
 
 
336 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  28.11 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  27.07 
 
 
350 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  28.53 
 
 
380 aa  122  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  31.28 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  28.16 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  28.79 
 
 
337 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  25.7 
 
 
395 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  27.08 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  30.25 
 
 
334 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  27.19 
 
 
397 aa  110  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.52 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  24.79 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  27.48 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  26.55 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  31.49 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.67 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  31.07 
 
 
173 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.65 
 
 
704 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  26.45 
 
 
171 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  28.4 
 
 
172 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  29.61 
 
 
184 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  29.48 
 
 
202 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  26.77 
 
 
182 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  24.72 
 
 
183 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.04 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  23.46 
 
 
181 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  24.28 
 
 
183 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  25.35 
 
 
189 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  24.65 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  24.84 
 
 
175 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  24.1 
 
 
187 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 
107 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  23.16 
 
 
189 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  24.64 
 
 
194 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  23.18 
 
 
175 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  25.32 
 
 
160 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  25.32 
 
 
160 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>