58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2213 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  100 
 
 
346 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  66.47 
 
 
348 aa  498  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.26 
 
 
425 aa  219  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.83 
 
 
419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.9 
 
 
423 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.9 
 
 
423 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.9 
 
 
423 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.47 
 
 
410 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.75 
 
 
417 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 
410 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.29 
 
 
410 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.08 
 
 
410 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.9 
 
 
417 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.8 
 
 
410 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.8 
 
 
410 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.8 
 
 
410 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.8 
 
 
410 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.11 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.86 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  28.85 
 
 
344 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  26.46 
 
 
340 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  27.27 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  24.38 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  24.03 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  24.32 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  23.02 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  21.87 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  23.23 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  22.01 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  21.79 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  25.28 
 
 
194 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  28 
 
 
704 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  24.31 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  21.49 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  25.84 
 
 
202 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  24.23 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  26.01 
 
 
171 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  25.99 
 
 
181 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  31.43 
 
 
172 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.27 
 
 
176 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  24.43 
 
 
183 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  27.01 
 
 
178 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  27.22 
 
 
173 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  25.86 
 
 
175 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  24.18 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  27.63 
 
 
189 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  25.32 
 
 
182 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  25.17 
 
 
189 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>