More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4118 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  48.7 
 
 
940 aa  897    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  48.7 
 
 
940 aa  895    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  50.21 
 
 
946 aa  965    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  50.26 
 
 
937 aa  920    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  49.64 
 
 
944 aa  920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  47.24 
 
 
954 aa  901    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  48.32 
 
 
944 aa  930    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  52.51 
 
 
942 aa  933    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  46.57 
 
 
931 aa  861    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  47.84 
 
 
954 aa  848    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  49.74 
 
 
958 aa  964    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  47.3 
 
 
943 aa  862    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0390  excinuclease ABC subunit A  46.62 
 
 
940 aa  848    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  49.22 
 
 
942 aa  893    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  48.31 
 
 
974 aa  880    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  48.39 
 
 
950 aa  880    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  49.32 
 
 
992 aa  914    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  49.84 
 
 
958 aa  964    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  49.84 
 
 
958 aa  964    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  49.84 
 
 
958 aa  965    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  48.96 
 
 
951 aa  920    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  48.75 
 
 
951 aa  918    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  49.22 
 
 
961 aa  917    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  48.87 
 
 
968 aa  893    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  49.58 
 
 
941 aa  884    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  52.81 
 
 
945 aa  988    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  49.49 
 
 
980 aa  928    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  47.81 
 
 
1008 aa  901    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  49.9 
 
 
940 aa  886    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  49.27 
 
 
965 aa  914    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3021  excinuclease ABC subunit A  50.1 
 
 
953 aa  882    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  49.53 
 
 
944 aa  913    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2966  excinuclease ABC subunit A  49.58 
 
 
952 aa  871    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.741995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  49.16 
 
 
937 aa  900    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  49.69 
 
 
976 aa  888    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  50.31 
 
 
987 aa  933    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  49.63 
 
 
937 aa  911    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2486  excinuclease ABC subunit A  48.58 
 
 
926 aa  855    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  47.28 
 
 
935 aa  870    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  49.84 
 
 
958 aa  964    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  48.07 
 
 
967 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  49.04 
 
 
1003 aa  917    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  48.34 
 
 
944 aa  863    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  51.36 
 
 
950 aa  921    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  53.42 
 
 
971 aa  967    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  47.83 
 
 
966 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  51.3 
 
 
976 aa  947    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  47.55 
 
 
970 aa  892    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  46.56 
 
 
953 aa  874    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  48.12 
 
 
946 aa  896    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  49.27 
 
 
939 aa  884    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  47.74 
 
 
957 aa  853    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3315  excinuclease ABC, A subunit  47.71 
 
 
978 aa  855    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000294803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  49.21 
 
 
941 aa  938    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  50.73 
 
 
957 aa  871    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  48.92 
 
 
968 aa  894    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  47.57 
 
 
955 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  49.16 
 
 
981 aa  905    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  47.9 
 
 
1004 aa  883    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1098  excinuclease ABC subunit A  48.35 
 
 
963 aa  865    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  48.35 
 
 
967 aa  882    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  51.14 
 
 
973 aa  940    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  51.39 
 
 
923 aa  871    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  48.91 
 
 
942 aa  884    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  48.67 
 
 
970 aa  865    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  45.68 
 
 
947 aa  860    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  49.12 
 
 
939 aa  958    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  48.91 
 
 
939 aa  954    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  48.14 
 
 
943 aa  877    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  46.69 
 
 
1004 aa  914    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  48.07 
 
 
950 aa  877    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  48.18 
 
 
950 aa  879    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2748  excinuclease ABC subunit A  51.25 
 
 
940 aa  892    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0880957  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3712  excinuclease ABC, A subunit  48.18 
 
 
953 aa  874    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0944752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  50.47 
 
 
942 aa  951    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  49.12 
 
 
957 aa  872    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  49.84 
 
 
945 aa  917    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  48.74 
 
 
943 aa  891    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  47.44 
 
 
952 aa  882    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  48.95 
 
 
953 aa  917    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  47.19 
 
 
952 aa  884    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  48.64 
 
 
941 aa  894    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  48.7 
 
 
975 aa  910    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  49.38 
 
 
950 aa  910    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  48.07 
 
 
950 aa  876    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  52.09 
 
 
947 aa  965    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  48.35 
 
 
954 aa  882    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  49.33 
 
 
959 aa  867    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  50.62 
 
 
1019 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0514  excinuclease ABC, A subunit  48.02 
 
 
942 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  51.14 
 
 
973 aa  940    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  46.49 
 
 
945 aa  860    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  51.04 
 
 
967 aa  941    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  50.1 
 
 
940 aa  918    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  48.5 
 
 
964 aa  885    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0366  excinuclease ABC subunit A  46.6 
 
 
941 aa  849    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2183  excinuclease ABC, A subunit  50.68 
 
 
945 aa  879    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.666287  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  48.47 
 
 
967 aa  915    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19031  excinuclease ABC subunit A  48.98 
 
 
966 aa  924    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  49.59 
 
 
980 aa  927    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>