67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2553 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  100 
 
 
389 aa  779    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  46.81 
 
 
364 aa  341  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  40.92 
 
 
389 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  33.66 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  33.66 
 
 
389 aa  199  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  41.03 
 
 
291 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  36.91 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  31.54 
 
 
469 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  32.13 
 
 
499 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  32.23 
 
 
470 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  31.03 
 
 
416 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  31.89 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  32.11 
 
 
442 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  31.84 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  32.55 
 
 
415 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  30.3 
 
 
448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  31.51 
 
 
446 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  33.7 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  30.75 
 
 
465 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  29 
 
 
559 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  27.2 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  28.85 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  28.85 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  28.85 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  32.25 
 
 
399 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  28.85 
 
 
429 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  28.05 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  26.78 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  27.49 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  26.22 
 
 
453 aa  116  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  31.21 
 
 
526 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  33.24 
 
 
391 aa  116  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  27.44 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  27.5 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  27.56 
 
 
462 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  27.9 
 
 
481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  29.38 
 
 
398 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  27.56 
 
 
423 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  28.87 
 
 
398 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  28.64 
 
 
427 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  26.75 
 
 
440 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  28.64 
 
 
414 aa  106  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  29.4 
 
 
426 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  29.4 
 
 
426 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  30 
 
 
397 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  29.27 
 
 
431 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  28.89 
 
 
426 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  29.27 
 
 
431 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  29.87 
 
 
450 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  28.06 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  28.37 
 
 
458 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  28.2 
 
 
479 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  25.07 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  27.13 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  25.24 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 
560 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  29.21 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  22.77 
 
 
539 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  22.16 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0892  phosphate-selective porin O and P  36.26 
 
 
511 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  23.7 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  26.64 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  29.5 
 
 
610 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0947  hypothetical protein  33.33 
 
 
512 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  33.72 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02677  Phosphate-selective porin O and P  24.32 
 
 
406 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 
475 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>