37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0900 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1109    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  34.56 
 
 		 610 aa  317  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  30.12 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  26.02 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  24.88 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  23.35 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  23.45 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  24.88 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  24.19 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  24.38 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  23.06 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  30.11 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  33.64 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  25.88 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  23.51 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  30.11 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  24.14 
 
 		 417 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  24.22 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  27.92 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  28.27 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  21.65 
 
 		 575 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  22.3 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  22.3 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  22.3 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  22.3 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  21.41 
 
 		 442 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  25.42 
 
 		 470 aa  47  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  26.61 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  26.61 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  22.39 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  22.63 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0892  phosphate-selective porin O and P  23.7 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0542  phosphate-selective porin O and P  23.38 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.63282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  22.99 
 
 		 291 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  26.71 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  25.69 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  25.69 
 
 		 426 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>