55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3100 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  94.43 
 
 		 431 aa  803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  99.53 
 
 		 426 aa  869    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 426 aa  872    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  93.27 
 
 		 431 aa  795    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  93.66 
 
 		 426 aa  794    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  93.68 
 
 		 427 aa  793    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  29.45 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  29.91 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  27.69 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  30.97 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  28.91 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  29.36 
 
 		 470 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  27.17 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  27.7 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  29.01 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  29.23 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  29.23 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  29.23 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  29.23 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  27.82 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  29.4 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  25.52 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  30.72 
 
 		 291 aa  99.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  27.16 
 
 		 464 aa  99.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  28.5 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  26.79 
 
 		 364 aa  97.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  27.95 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  28.77 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  24.23 
 
 		 453 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  27.58 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  28.3 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  26.83 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  26.26 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  26.46 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  28.87 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  27.06 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  28.39 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  28.52 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  22.97 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.68 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  28.39 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  26.22 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  26.32 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  25.13 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  26.37 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  24.76 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.49 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  24.26 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  25.9 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  24.91 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  24.65 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  21.22 
 
 		 560 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  31.33 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  22.14 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  25.69 
 
 		 539 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>