64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2418 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
469 aa  962    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  60.09 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  39.14 
 
 
499 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  35.75 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  33.5 
 
 
442 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  33.49 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  33.42 
 
 
446 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  32.67 
 
 
559 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  31.54 
 
 
389 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  32.05 
 
 
452 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  33.42 
 
 
415 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  30.93 
 
 
465 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  27.86 
 
 
462 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  35.88 
 
 
291 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  29.64 
 
 
448 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  30.12 
 
 
450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  31.32 
 
 
479 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  30.58 
 
 
364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  29.28 
 
 
453 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  28.29 
 
 
435 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  28.29 
 
 
429 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  28.29 
 
 
435 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  28.29 
 
 
435 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  31.43 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  29.24 
 
 
437 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  28.36 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  29.76 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  29.27 
 
 
423 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  27.12 
 
 
437 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  29.62 
 
 
399 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  27.01 
 
 
438 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  31.19 
 
 
389 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  27.27 
 
 
438 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 
526 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  29.6 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  30.97 
 
 
426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  30.57 
 
 
427 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  29.95 
 
 
426 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  30.57 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  32.11 
 
 
389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  31.77 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  30 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  31.1 
 
 
390 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  27.68 
 
 
416 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  29.64 
 
 
431 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  30.66 
 
 
575 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  29.06 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  29.68 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  24.88 
 
 
539 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  25.2 
 
 
560 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  22.91 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  24.6 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  23.73 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  22.52 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  27.64 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  26.43 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  24.63 
 
 
610 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  25.21 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  23.66 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  24.22 
 
 
397 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  25.31 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  24.83 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  22.97 
 
 
426 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4037  phosphate-selective porin O and P  21.65 
 
 
426 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>