59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1248 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  75.11 
 
 		 438 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 437 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  75.34 
 
 		 438 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  69.68 
 
 		 440 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  69.81 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  65.65 
 
 		 437 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  63.7 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  63.7 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  63.7 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  63.7 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  29.02 
 
 		 464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  29.24 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  29.34 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  30.39 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  30.39 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  29.83 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  29.15 
 
 		 426 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  28.99 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  30.71 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  28.05 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  29.9 
 
 		 431 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  30.21 
 
 		 499 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  27.42 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  28.98 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  25.97 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  29.5 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  28.8 
 
 		 291 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  26.59 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  26.29 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  27.72 
 
 		 391 aa  90.1  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  28.84 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  25.49 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  24.01 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  26.57 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  25.25 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  26.43 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  25.19 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  26.1 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  31.51 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  24.89 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  25.44 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  25.51 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  27.24 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  24.29 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  26.91 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  24.51 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  25.52 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  27.62 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  23.98 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  32.18 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  23.22 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  22.75 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  22.19 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  21.12 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  24.43 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  24.06 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  21.52 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4037  phosphate-selective porin O and P  21.75 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>