58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3950 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 446 aa  906    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  90.5 
 
 		 442 aa  777    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  98.21 
 
 		 446 aa  892    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  42.48 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  44.05 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  34.07 
 
 		 469 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  31.89 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  32.21 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  30.19 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  30.26 
 
 		 499 aa  143  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  28.42 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  29.65 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  31.39 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  28.3 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  26.17 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  29.57 
 
 		 291 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  30.72 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  29.85 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  29.41 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  28 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  29.14 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  28.87 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  27.32 
 
 		 479 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  28.9 
 
 		 391 aa  93.6  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  27.95 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  27.98 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  27.95 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  27.98 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  27.98 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  29.96 
 
 		 462 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  27.72 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  27.03 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  24.87 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.8 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  25.62 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  26.13 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  24.69 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  24.37 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  23.69 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  22.19 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  22.19 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  22.19 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  22.19 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  26.25 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  25.87 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  25.74 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  24.21 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  24.76 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  25.68 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  24.16 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  30.07 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  23.8 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  23.08 
 
 		 560 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  23.5 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  24.2 
 
 		 414 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  21.43 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  21.86 
 
 		 539 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  22.54 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>