65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2076 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 470 aa  948    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  39.36 
 
 		 499 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  35.75 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  34.13 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  35.11 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  32.52 
 
 		 559 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  36.22 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  32.94 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  32.23 
 
 		 389 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  39.78 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  31.18 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  31.41 
 
 		 462 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  31.97 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  29.42 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  29.85 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  33.24 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  30.85 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  32.45 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  30.42 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  30.28 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  30.19 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  28.99 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  30.1 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  28.83 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  32.67 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  27.63 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  31 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  31.02 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  28.88 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  28.88 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  28.88 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  28.88 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  30.56 
 
 		 416 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  26.21 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  28.57 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  29.36 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  28.91 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  28.88 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  29.38 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  31.08 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  28.47 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  28.84 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  29.11 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  28.64 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  29.5 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  29.38 
 
 		 418 aa  97.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  28.05 
 
 		 575 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  29.32 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  27.73 
 
 		 398 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  27.73 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  24.41 
 
 		 560 aa  80.1  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  24.52 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  23.16 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  25.57 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  30.24 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  23.93 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  25.34 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  27.86 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  23.99 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  25 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  34.88 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0330  phosphate-selective porin O and P  31.43 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0341  phosphate-selective porin O and P  31.43 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0542  phosphate-selective porin O and P  28.26 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.63282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0319  phosphate-selective porin O and P  31.37 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>