57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0924 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  96.53 
 
 
431 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
427 aa  874    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  98.59 
 
 
426 aa  833    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  96.3 
 
 
431 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  93.68 
 
 
426 aa  792    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  94.15 
 
 
426 aa  794    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  29.53 
 
 
437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  30.39 
 
 
437 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  28.16 
 
 
440 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  28.44 
 
 
448 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  30.47 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  30.57 
 
 
469 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  27.82 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  30.94 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  30.94 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  30.94 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  30.94 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  28.21 
 
 
450 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  30.56 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  29.15 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  28.64 
 
 
389 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 
499 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  27.84 
 
 
391 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  30.48 
 
 
291 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  27.65 
 
 
464 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  25.06 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  25.37 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  26.47 
 
 
364 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  27.57 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  26.8 
 
 
481 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  28.02 
 
 
452 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  27.54 
 
 
465 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  26.17 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  27.09 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  23.35 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  27.69 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  27.64 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  26.94 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  26.86 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.6 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  26.5 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  27.62 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  25.58 
 
 
559 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  28.39 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  25.32 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  25.42 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  26.62 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  24.07 
 
 
462 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  25.44 
 
 
575 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.81 
 
 
458 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  27.88 
 
 
376 aa  56.6  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  24.41 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  21.56 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  20 
 
 
560 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3329  phosphate-selective porin O and P  23.91 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000579817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0227  hypothetical protein  35.14 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  26.03 
 
 
539 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>