56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0293 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  100 
 
 		 389 aa  805    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  98.2 
 
 		 389 aa  796    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  65.81 
 
 		 389 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  68.03 
 
 		 390 aa  534  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  33.66 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  30.81 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  32.21 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  31 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  30.68 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  32.11 
 
 		 469 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  31.31 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  30.29 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  28.49 
 
 		 526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  31.84 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  32.03 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  33.22 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  30.54 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  29.39 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  28.26 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  28.62 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  27.72 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  28.06 
 
 		 450 aa  89.7  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  30.51 
 
 		 479 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  28.87 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  28.87 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  27.53 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  26.52 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  27.18 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  24.1 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  25.3 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  26.86 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  26.86 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  28.34 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  23.67 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.95 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  23.67 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  23.67 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  24.83 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  23.67 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  25.98 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  24.3 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  26.58 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  24.72 
 
 		 481 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  25.57 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  24.92 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  24.45 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  23.15 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  25.95 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  30.61 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  25.11 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  22.56 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  21.6 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  31.29 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  22.83 
 
 		 575 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>