56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02397 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  100 
 
 
390 aa  804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  66.58 
 
 
389 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  66.06 
 
 
389 aa  541  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  68.03 
 
 
389 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  36.91 
 
 
389 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  30.7 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  32.54 
 
 
416 aa  142  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  31.99 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  32.2 
 
 
291 aa  116  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  30.27 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  31.1 
 
 
469 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  31.08 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  30.66 
 
 
446 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  26.58 
 
 
499 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  30.66 
 
 
446 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  29.56 
 
 
442 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  31.9 
 
 
450 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  28.96 
 
 
399 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  27.98 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  29.82 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  25.35 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  27.23 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  27.78 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  29.49 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  29.3 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  26.98 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  26.58 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  26.22 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  29.18 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  25.84 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  28.83 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  25.8 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  33.33 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  25.8 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  25.8 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  25.8 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  27.05 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  25.75 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  24.73 
 
 
575 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.37 
 
 
458 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  26.62 
 
 
427 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  30.66 
 
 
438 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  26.62 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  26.69 
 
 
438 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  26.38 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  29.18 
 
 
481 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  24.49 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  25.89 
 
 
431 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  22.77 
 
 
559 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  25.89 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  32.18 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  24.01 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  24.81 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  26.79 
 
 
560 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>