56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00788 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  100 
 
 		 416 aa  844    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  31.16 
 
 		 389 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  30.08 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  32.67 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  32.21 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  32.54 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  30.9 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  32.89 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  30.56 
 
 		 470 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  27.82 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  29.83 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  28.57 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  29.56 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  28.01 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  28.01 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  28.01 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  28.01 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  27.63 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  28.82 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  28.34 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  28.21 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  28.48 
 
 		 464 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  26.51 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  29.85 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  26.75 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  29.05 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  26 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  26.28 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  28.21 
 
 		 499 aa  90.5  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  29.72 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  28.14 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  29.63 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  25.37 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  27.47 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  29.85 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  28.62 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  26.45 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  27.71 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  27.14 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  27.22 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  26.33 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  25.32 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  25.65 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  25.32 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  23.8 
 
 		 559 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  25.32 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  23.84 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  24.68 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  25.62 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  26.37 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  28.2 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  25.72 
 
 		 458 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  20.68 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  20.61 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  26.79 
 
 		 560 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>