58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0054 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
429 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
435 aa  882    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
435 aa  882    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  73.44 
 
 
423 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
435 aa  882    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  72.75 
 
 
440 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  69.77 
 
 
437 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  68.18 
 
 
438 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  68.9 
 
 
438 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  64.51 
 
 
437 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  28.29 
 
 
469 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  27.32 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  28.85 
 
 
389 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  28.88 
 
 
470 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  30.94 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  30.94 
 
 
426 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  27.45 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  30.69 
 
 
431 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  30.45 
 
 
431 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  27 
 
 
499 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  26.64 
 
 
559 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  29.83 
 
 
426 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  29.83 
 
 
426 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  26.34 
 
 
465 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  28.77 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  26.68 
 
 
364 aa  93.2  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  27.61 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  27.94 
 
 
291 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  25.13 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  27.86 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  25.32 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  24.51 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  26.47 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  27.11 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  21.93 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  23.59 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  23.67 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  26.5 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  24.75 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  24.38 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  24.75 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  26.09 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  26.67 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  21.79 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  24.2 
 
 
452 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  25.26 
 
 
526 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  21.28 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  26.84 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  24.3 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 
560 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  22.3 
 
 
539 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  31.54 
 
 
575 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  21.18 
 
 
404 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>