42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2230 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 458 aa  924    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  46.08 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  40.9 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  41 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  29.62 
 
 		 470 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  31.74 
 
 		 399 aa  140  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  27.93 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  29.57 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  29.67 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  28.34 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  25.49 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  28.22 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  25.87 
 
 		 481 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  30.07 
 
 		 291 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  26.43 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  26 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  26.39 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  26.97 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  26.26 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  27.61 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  24.27 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  26.6 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  26.83 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  26.69 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  27.46 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  23.31 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  27.25 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  24.54 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  26.2 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  26.54 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  26.82 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  25.94 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  25.67 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  26.38 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  26.18 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  27.34 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  22.66 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  25.67 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  25.72 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  26.31 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  26.69 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  25.93 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>