51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02409 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02409  porin O  100 
 
 		 397 aa  817    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  60.48 
 
 		 391 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  55.08 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  55.08 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  30.26 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  29.72 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  29.95 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  30 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  30.59 
 
 		 499 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  29.59 
 
 		 559 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  27.57 
 
 		 427 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  27.46 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  27.72 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  27.2 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  27.99 
 
 		 431 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  27.74 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  28.62 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  25.44 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  29.78 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  27.7 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  28.86 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  27.92 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  28.81 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  27.06 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  25.98 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  25.82 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  26.09 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  26.09 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  26.09 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  25.98 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.25 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  24.31 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  24.73 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  26.99 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  26.78 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  26.46 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  22.92 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  27.07 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  25.66 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  26.32 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  24.22 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  24.74 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  24.74 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  24.37 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  27.05 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  20.73 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  26.4 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  26.12 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  24.66 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  25 
 
 		 575 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  25.86 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>