63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2417 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
464 aa  954    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  60.09 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  33.56 
 
 
499 aa  242  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  34.13 
 
 
470 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  32.16 
 
 
559 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  31.89 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  28.39 
 
 
462 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  29.48 
 
 
465 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  29.5 
 
 
442 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  30.88 
 
 
452 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  31.18 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  30.46 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  31.3 
 
 
446 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  33.24 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  30.3 
 
 
364 aa  141  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  29.02 
 
 
437 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  29.1 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  28.37 
 
 
438 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  27.46 
 
 
448 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  27.32 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  27.32 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  27.32 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  28.05 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  27.32 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  26.97 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  28.54 
 
 
440 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  31.11 
 
 
450 aa  127  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  26.84 
 
 
481 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  28.17 
 
 
438 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  25.55 
 
 
450 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  31.23 
 
 
291 aa  123  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  29.43 
 
 
526 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  27.08 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  26.92 
 
 
575 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  25.4 
 
 
458 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  27.16 
 
 
426 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  27.16 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  30.87 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  30.54 
 
 
389 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  27.65 
 
 
427 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  27.48 
 
 
426 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  28.48 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  29.05 
 
 
389 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  26.96 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  26.72 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  28.99 
 
 
391 aa  87  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  27.23 
 
 
390 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  24.53 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  24.23 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  25.92 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  26.19 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  22.16 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  25.33 
 
 
398 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  23.97 
 
 
560 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  26.62 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  23.86 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  21.93 
 
 
357 aa  60.1  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  24.37 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 
475 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  26.81 
 
 
610 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  30.61 
 
 
397 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  23.8 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  23.85 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>