30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2169 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 475 aa  992    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  52.5 
 
 		 473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0892  phosphate-selective porin O and P  44.98 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0542  phosphate-selective porin O and P  46.75 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.63282  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0947  hypothetical protein  38.08 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  41.28 
 
 		 554 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3817  hypothetical protein  40.78 
 
 		 417 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  40.51 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  40.93 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2588  phosphate-selective porin O and P  38.97 
 
 		 480 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03751  phosphate-selective porin O and P  43.08 
 
 		 292 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03753  phosphate-selective porin O and P  48.04 
 
 		 203 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  27.68 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  27.1 
 
 		 559 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  32.43 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  25.17 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0174  phosphate-selective porin O and P  21.86 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.240842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  33.61 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  32.41 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4123  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  22.63 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1082  phosphate-selective porin O and P  30.05 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  30.56 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  34.88 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  31.48 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4149  phosphate-selective porin O and P  23.56 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  30.83 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  33.72 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4007  hypothetical protein  23.56 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1222  phosphate-selective porin O and P  27.93 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285474  hitchhiker  0.000149308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>