60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3355 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 397 aa  801    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  31.76 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  29.59 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02677  Phosphate-selective porin O and P  23.59 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03751  phosphate-selective porin O and P  33.97 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2106  phosphate-selective porin O and P  28.69 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0947  hypothetical protein  31.28 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  27.97 
 
 		 610 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  26.06 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  28.79 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  21.53 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0341  phosphate-selective porin O and P  25.94 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  23.89 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0330  phosphate-selective porin O and P  25.68 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  22.33 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  28.34 
 
 		 464 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0319  phosphate-selective porin O and P  25.42 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2159  phosphate-selective porin O and P  27.67 
 
 		 438 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  32.84 
 
 		 575 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  31.87 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4411  phosphate-selective porin O and P  29.32 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  21.21 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  27.12 
 
 		 473 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0576  hypothetical protein  25.73 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0892  phosphate-selective porin O and P  27.23 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  27.87 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  35.8 
 
 		 559 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  26.51 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  26.14 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  25.46 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0542  phosphate-selective porin O and P  25.76 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.63282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  24.57 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4037  phosphate-selective porin O and P  21.98 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0510  phosphate-selective porin O and P  23.37 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2741  major outer membrane protein 40  26.06 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2362  phosphate-selective porin O and P  26.06 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000124461  unclonable  0.0000000000787555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  31.14 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3887  phosphate-selective porin O and P  34.62 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  22.9 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.05 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  28.76 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0174  phosphate-selective porin O and P  24.84 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.240842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  27.57 
 
 		 526 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3315  hypothetical protein  27.98 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  26.69 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3459  hypothetical protein  27.98 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3395  hypothetical protein  27.98 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  29.76 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2588  phosphate-selective porin O and P  29.25 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  28.98 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  28.77 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0417  phosphate-selective porin O and P  26.46 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3377  hypothetical protein  35.05 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0640  phosphate-selective porin O and P  26.2 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  28.95 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0105  hypothetical protein  24.02 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  27.27 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3329  phosphate-selective porin O and P  22.76 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000579817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  23.5 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>