36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2627 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 417 aa  852    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  65.79 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3329  phosphate-selective porin O and P  43.28 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000579817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4037  phosphate-selective porin O and P  41.8 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  41.69 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02677  Phosphate-selective porin O and P  26.03 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  25.19 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  24.6 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5308  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0811  phosphate-selective porin O and P  28.71 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  23.86 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  22.16 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  22.65 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  24.14 
 
 		 539 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  22.82 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  24.79 
 
 		 610 aa  53.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  22.14 
 
 		 364 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  25.3 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  23 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  26.25 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  25.6 
 
 		 559 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  24.59 
 
 		 438 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  23.79 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  24.63 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  24.75 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3267  hypothetical protein  25.4 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.0328841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  24.59 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  24.36 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  26.4 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  24.22 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  28.31 
 
 		 502 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  28.31 
 
 		 502 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>