163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1086 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  100 
 
 		 348 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  89.28 
 
 		 347 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  87.36 
 
 		 348 aa  634    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  97.13 
 
 		 348 aa  700    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  98.56 
 
 		 348 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  87.93 
 
 		 348 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  97.99 
 
 		 348 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  87.36 
 
 		 348 aa  634    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  87.83 
 
 		 347 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  87.36 
 
 		 348 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  80.98 
 
 		 348 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  69.62 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  69.62 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  69.62 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  68.14 
 
 		 343 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  68.13 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  69.62 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  67.94 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  68.13 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  67.84 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  68.14 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  64.72 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  68.14 
 
 		 343 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  68.14 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  68.14 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  66.37 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  65.49 
 
 		 342 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  67.85 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  68.53 
 
 		 342 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  66.96 
 
 		 344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  64.72 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  63.66 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  65.78 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  64.33 
 
 		 366 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  62.91 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  63.42 
 
 		 342 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  63.08 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  66.18 
 
 		 354 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  63.48 
 
 		 353 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  64.06 
 
 		 353 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  65.03 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  64.74 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  63.16 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  63.48 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  64.53 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  64.74 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  64.74 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  64.53 
 
 		 352 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  61.52 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  63.64 
 
 		 345 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  64.24 
 
 		 352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  64.24 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  62.94 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  64.45 
 
 		 354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  64.24 
 
 		 352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  63.56 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  64.24 
 
 		 352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  64.24 
 
 		 352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  64.24 
 
 		 352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  63.27 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  64.16 
 
 		 364 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  63.37 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  60 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  61.18 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  61.85 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  62.57 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  64.14 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  62.03 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  61.29 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  62.79 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  62.8 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  61.11 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  60.82 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  59.59 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  62.57 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  62.5 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  61.4 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  57.94 
 
 		 351 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  59.3 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  61.36 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  61.65 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  60.12 
 
 		 345 aa  421  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  57.35 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  60.41 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  59.37 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  58.21 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  57.57 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1632  dihydroorotase  56.9 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000370433  hitchhiker  0.000720475 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  60 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1865  dihydroorotase  57.14 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0106895  normal  0.0377917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  58.82 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  58.31 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  58.88 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  59.01 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  56.73 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  56.05 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  56.73 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  55.16 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  56.05 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>