169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00682 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  100 
 
 		 348 aa  728    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  74.2 
 
 		 345 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  75.22 
 
 		 344 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  72.97 
 
 		 344 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  69.97 
 
 		 343 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  73.04 
 
 		 345 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  72.59 
 
 		 344 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  64.71 
 
 		 348 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  64.04 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  63.16 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  62.94 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  62.94 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  62.65 
 
 		 348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  63.85 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  63.24 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  62.65 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  63.56 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  61.34 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  61.34 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  61.34 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  63.74 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  61.92 
 
 		 343 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  61 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  61.76 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  61.45 
 
 		 342 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  60.12 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  61.05 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  59.94 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  58.43 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  59.94 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  60.64 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  60.76 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  60.93 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  60.29 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  61.81 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  60 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  61.34 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  58.94 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  59.88 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  60.76 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  60.7 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  57.06 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  58.94 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  59.01 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  56.81 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  58.77 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  57.8 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  58.94 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  59.01 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  59.01 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  58.72 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  57.82 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  57.8 
 
 		 353 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  59.77 
 
 		 355 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  58.43 
 
 		 364 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  58.96 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  56.27 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  57.1 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  58.72 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  57.94 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  57.59 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  58.48 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  58.94 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  57.43 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  59.24 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  58.68 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  58.38 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  58.26 
 
 		 352 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  55.59 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  57.97 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  57.97 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  56.64 
 
 		 349 aa  401  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  57.97 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  57.97 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  57.97 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  57.97 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1632  dihydroorotase  54.24 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000370433  hitchhiker  0.000720475 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  55.81 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  56.76 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  56.23 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  54.65 
 
 		 348 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  57.39 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  54.65 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  54.65 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  55.23 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  54.55 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1865  dihydroorotase  54.13 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0106895  normal  0.0377917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  56.27 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  54.84 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  54.23 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  54.07 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  54.36 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  54.07 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  54.36 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  55.56 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  54.07 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  54.07 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>