171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1632 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1632  dihydroorotase  100 
 
 		 358 aa  747    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000370433  hitchhiker  0.000720475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1865  dihydroorotase  96.06 
 
 		 356 aa  721    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0106895  normal  0.0377917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  72.88 
 
 		 373 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  57.47 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  57.47 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  54.83 
 
 		 366 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  56.9 
 
 		 348 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  57.76 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  57.02 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  56.61 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  56.9 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  56.03 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  55.17 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  55.14 
 
 		 344 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  54.24 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  54.86 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  54.89 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  54.29 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  54.6 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  55.04 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  53.43 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  53.43 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  53.56 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  51.57 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  52.99 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  53.28 
 
 		 354 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  54.29 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  52.57 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  54.15 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  51.57 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  52.71 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  53.31 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  54.29 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  53.26 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  53.43 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  52.79 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  53.26 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  53.58 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  52.01 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  50.57 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  52.42 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  51.98 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  51.13 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  51.55 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  51.55 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  52.71 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  51.55 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  52.6 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  52.44 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  50 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  51.01 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  51.01 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  52.3 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  49.44 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  50.85 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  53.3 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  49.44 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  52.42 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  52.29 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  51.55 
 
 		 349 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  53.12 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  51.87 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  50.84 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  50.56 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  50.84 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  51.58 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  52.3 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  50.56 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  52.56 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  52.3 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  54.02 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  50.14 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  50.56 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  50.56 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  50.56 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  50.56 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  50.71 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  52.42 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  50.56 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  50.71 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  52.01 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  52.01 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  50.28 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  51.72 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  50.28 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  51.98 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  49.01 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  52.17 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  52.16 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  52.17 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  51.72 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  50 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  50.85 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  50 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>