174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1147 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  100 
 
 
347 aa  717    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  61.29 
 
 
366 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  62.76 
 
 
344 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  62.17 
 
 
344 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  60.82 
 
 
344 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  56.76 
 
 
346 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  59.54 
 
 
353 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  58.43 
 
 
347 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  58.43 
 
 
347 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  58.43 
 
 
347 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  60.41 
 
 
344 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  60.41 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  58.4 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  58.4 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  58.89 
 
 
354 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  60.06 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  58.4 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  58.4 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  58.29 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  58.4 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  58.4 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  57.85 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  58.38 
 
 
354 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  58.48 
 
 
348 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  58.96 
 
 
353 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  58.31 
 
 
354 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  57.55 
 
 
352 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  58.31 
 
 
364 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  58.77 
 
 
343 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  58.31 
 
 
364 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  58.14 
 
 
342 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  59.53 
 
 
348 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  58.31 
 
 
354 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  58.88 
 
 
345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  55.23 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  57.73 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  58.48 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  57.6 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  56.89 
 
 
349 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  56.98 
 
 
343 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  58.6 
 
 
347 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  57.73 
 
 
364 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  59.24 
 
 
345 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  57.02 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  57.27 
 
 
342 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  57.6 
 
 
348 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  57.56 
 
 
343 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  57.31 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  57.6 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  55.39 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  56.3 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  56.98 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  57.31 
 
 
346 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  57.06 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  57.02 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  57.56 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  57.89 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  58.06 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  57.73 
 
 
345 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  57.27 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  58.14 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  57.56 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  56.73 
 
 
347 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  54.52 
 
 
355 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  57.73 
 
 
347 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  56.85 
 
 
355 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  61.34 
 
 
346 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  55.36 
 
 
347 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  55.49 
 
 
343 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  56.73 
 
 
348 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  57.48 
 
 
350 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  56.73 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  57.74 
 
 
350 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  56.64 
 
 
359 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  60.56 
 
 
346 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  55.72 
 
 
345 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  58.04 
 
 
347 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  54.25 
 
 
342 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  56.89 
 
 
345 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  58.53 
 
 
348 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  57.82 
 
 
347 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  56.43 
 
 
348 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  54.46 
 
 
347 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  56.05 
 
 
346 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  56.43 
 
 
347 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  53.57 
 
 
347 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1632  dihydroorotase  51.57 
 
 
358 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000370433  hitchhiker  0.000720475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1865  dihydroorotase  51.28 
 
 
356 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0106895  normal  0.0377917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  54.49 
 
 
354 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  55.62 
 
 
352 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  58.97 
 
 
346 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  56.4 
 
 
347 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  59.29 
 
 
346 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  53.96 
 
 
382 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  53.96 
 
 
382 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  58.97 
 
 
346 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  53.1 
 
 
348 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  55.59 
 
 
345 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  51.72 
 
 
373 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  52.33 
 
 
343 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>