169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2567 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  90.4 
 
 		 353 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  87.54 
 
 		 354 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  100 
 
 		 354 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  89.55 
 
 		 353 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  87.25 
 
 		 354 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  87.25 
 
 		 364 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  87.25 
 
 		 364 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  85.84 
 
 		 354 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  84.79 
 
 		 352 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  84.79 
 
 		 352 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  84.79 
 
 		 352 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  84.79 
 
 		 352 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  84.79 
 
 		 352 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  84.79 
 
 		 352 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  84.79 
 
 		 378 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  83.57 
 
 		 364 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  83.29 
 
 		 354 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  84.51 
 
 		 352 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  78.61 
 
 		 344 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  78.26 
 
 		 344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  78.55 
 
 		 344 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  79.47 
 
 		 344 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  78.89 
 
 		 344 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  74.29 
 
 		 348 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  72.52 
 
 		 355 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  72.44 
 
 		 355 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  73.26 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  72.75 
 
 		 343 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  70.11 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  69.34 
 
 		 359 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  71.09 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  71.09 
 
 		 350 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  68.19 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  68.29 
 
 		 347 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  68.39 
 
 		 346 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  64.64 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  65.8 
 
 		 346 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  62.72 
 
 		 345 aa  471  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  62.14 
 
 		 345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  68.51 
 
 		 345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  64.16 
 
 		 352 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  65.01 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  65.1 
 
 		 343 aa  461  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  64.93 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  65.13 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  63.48 
 
 		 344 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  64.35 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  64.93 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  63.77 
 
 		 345 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  61.22 
 
 		 343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  64.35 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  63.48 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  63.37 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  63.77 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  61.22 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  61.22 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  61.22 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  63.19 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  63.19 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  62.32 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  61.81 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  62.03 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  60.76 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  61.92 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  61.22 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  60.93 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  62.21 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  60.64 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  61.56 
 
 		 350 aa  434  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  60.93 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  58.94 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  61.7 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  57.56 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  57.27 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  62.61 
 
 		 345 aa  425  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  58.31 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  58.02 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  60.53 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  58.05 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  58.05 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  58.14 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  59.42 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  58.38 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  58.6 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  58.96 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  59.13 
 
 		 346 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  60.82 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  57.97 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  57.68 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  59.42 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  53.8 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  53.6 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  56.65 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  55.56 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  58.6 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19692  predicted protein  55.34 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  53.8 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  53.06 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  56.1 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  56.23 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>