170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18131 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  100 
 
 		 354 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  66.76 
 
 		 357 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  65.9 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  60.4 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  59.65 
 
 		 354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0892  dihydroorotase  63.9 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.930238  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  58.91 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  58.45 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  56.82 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  56.53 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06331  dihydroorotase  53.78 
 
 		 349 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  57.88 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  57.39 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  56.9 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  55.56 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  56.41 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  56.73 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  55.33 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  54.49 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05951  dihydroorotase  52.33 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  56.45 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  54.2 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  52.15 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06251  dihydroorotase  53.24 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  53.74 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  55.84 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  53.41 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  53.41 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0569  dihydroorotase  51.74 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  53.58 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  53.95 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  55.3 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  54.62 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  53.41 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  53.58 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  54.26 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  55.01 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  53.91 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  54.47 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  53.39 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  53.62 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  55.01 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  55.01 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  55.01 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  52.89 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  52.14 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  53.74 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  51.71 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  52.82 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  53.11 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  52.82 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  53.11 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  57.69 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  55 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  54.31 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  52.87 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  51.71 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  53.11 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  54.71 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  51.71 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  51.84 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  51.43 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  50.99 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  52 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  53.3 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  59.03 
 
 		 346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  50.86 
 
 		 353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  51.27 
 
 		 352 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  51.27 
 
 		 352 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  51.27 
 
 		 352 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  51.27 
 
 		 352 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  51.27 
 
 		 352 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  51.27 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  53.33 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  52.75 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  52.75 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  51.56 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  51.85 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  56.33 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  51.86 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  56.41 
 
 		 350 aa  358  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  49.57 
 
 		 359 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  53.49 
 
 		 344 aa  358  8e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  50.72 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  51.29 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  56.01 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  51.17 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  55.77 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  49.57 
 
 		 342 aa  355  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  50.72 
 
 		 348 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  52.89 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  56.09 
 
 		 346 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  51.45 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>